Universitas Islam Jakarta mempunyai lambang bertuliskan " Rabbi Zidnii Ilman " yang bersumber dari Al Quran surat Thaha ayat 114, yang artinya : Ya Tuhanku,tambahkanlah kepadaku Ilmu dalam bentuk "Pyramid ", warna dasar  Hitam , dengan warna tulisan dan lingkaran  Kuning Emas.

rn

Bendera Universitas Islam Jakarta terdiri dari bendera Universitas dan Fakultas, berbentuk persegi panjang, ditengahnya bertuliskan Lambang Universitas warna kuning emas, perbandingan ukuran 3 : 2 dengan warna dasar masing-masing sebagai berikut :
1.  Bendera Universitas berwarna hitam
2.  Bendera Fakultas Hukum berwarna hijau
3.  Bendera Fakultas Ekonomi berwarna kuning
4.  Bendera Fakultas Agama Islam berwarna putih
5.  Bendera Fakultas Teknik berwarna biru
6.  Bendera Magister Agama Islam berwarna ungu
7.  Bendera Magister Ilmu Hukum berwarna merah
8.  Bendera Magister Manajemen berwarna kuning muda 

rn